Subio Platform v1.24.5859 をリリースしました。GDCの仕様が変更されて以来、TCGAのRNA-Seq サンプルをダウンロードできなくなっていた問題を解消しました。
この変更に伴い、GDC RNA-Seqデータの遺伝子IDも変更されています。これにより、古いGDC RNA-Seq用のPlatformでは対応できなくなっています。Platformのリストに、GDC RNA-Seq という名前のPlatformしかない場合は、こちらから新しいPlatformをインポートするためのSSAファイルをダウロードしてください。 Fileメニューから "Import SSA/SOA file..." を選択して、ダウンロードしたSSAファイルを取り込むことで、GDC RNA-Seq for STAR Counts という名前のPlatformができます。今後 GDC からRNA-Seq STAR Countsデータのサンプルをインポートする時は、このPlatformにインポートするようにしてください。
Fixed Bugs
- GDCからTCGAのRNA-Seq サンプルをダウンロードできない。
- 新しい macOS で、FASTQ to VCF ツールを動かせないことがある。
- リード数が21.5億以上だと、FASTQファイル のインポートができない。
Update your Subio Platform.
Subio PlatformのHelpメニューから、"Check for Updates..."を実行してください。または下記のリンクからアップデータをダウンロードして、手動で更新してください。