データ解析サービス

実験をまだされていない方は、プレミアム解析サービスをご検討ください。 すでに測定された実験データをお持ちの方や、測定システムのアセスメントのために他の研究者のデータを詳しくご覧になりたい方は、下記をお読みください。

Subio's Products and Services データ解析サービス(アセスメントとして) プレミアム解析サービス FASTQファイル処理サービス データ解析サービス Plug-ins Subio Platform Subrium Balloons are designed by Freepik.

マイクロアレイやRNA-Seqの発現データ解析の結果というと、ほとんどの人がFold値やP値付きの遺伝子リストや、ヒートマップの図などのことを思うのではないでしょうか。 実際に解析を依頼した場合に帰ってくるのは、エクセルとPDFファイルであることがほとんどです。 しかしこれでは、その結果の信頼性などを含めて解析結果を解釈するには情報が足りません。

一般にデータ解析と呼ばれていることは入り口にすぎません。 オミクスデータの解析で難しいのは、その先の解釈です。 オミクスデータは複雑なので、様々な角度から検証する必要があります。 この多面性により、オミクスデータは人によってさまざまな解釈が可能です。 言い方を変えれば、間違った解釈をしやすいです。 正しく解釈するためには、そのデータの特徴とそれまでの解析手順についてきちんと理解する必要があるのですが、 エクセルやPDFが持つ情報は最初(生データ)と最終(遺伝子リストやヒートマップ)だけなので、検証ができないのです

SubioのData Analysis Serviceでは、お客様から生データをお預かりしたものを、SSA(Subio Series Archive)ファイルにして納品します。 このSSAファイルをSubio Platformにインポートすると、 生データと最終結果はもちろんですが、解析ステップの途中結果もすべてご覧になれます。 データの正規化・前処理、フィルタリング、統計解析、多変量解析などの解析ステップをすべて見ることができ、 その一つ一つについて解説しますので、そのデータについてお客様が正しく理解するのをサポートします。

しかし、わたしたちにできるのはここまでです。 この先はお客様ご自身でデータを深く見て、解釈していくことになります。 全体のワークフローをご覧になって、私たちにできる部分と、お客様ご自身でやらなければならない部分をご確認ください。

これまで多くのお客様にご利用いただいており、中にはNature誌の論文になった例もあります。

データ解析サービスフロー

解析結果の解釈し、生物学的に有意な発見をすることは非常に困難な作業です。 お客様が立ち向かわなければならないこの困難な作業を、私たちは次の三つの点で支援します。

  1. 無料のオンラインサポート
  2. 「チームによる共同作業」をサポート
  3. 「他の研究データとの比較」をサポート

無料のオンラインサポート

納品時に、ウェブ会議でそのデータの特徴と、限界、そしてもしあれば問題点をSubio Platformを使って具体的に明示しながら説明します。 そして、そのデータの特徴に合わせてどのような解析手法を選択したかを、順を追って解説します。 初心者の方にとっては、これだけでも非常に有用です。 なぜならほとんどの方がデータの特徴に合っているかどうかも考えずに、教科書の手順をそのまま当てはめようとするからです。 オミクスデータ解析について学びたければ、教科書を読むより、多種多様なデータの解析をSubioにご依頼いただくほうがずっと早く、深く学ぶことができます。

その後もご不明な点はウェブ会議でいつでもご相談いただけます。 何度でも無料でご利用いただけますので、一度にまとめてというより、疑問が出てきたときにその都度ご相談いただくのが効果的です。

オンラインサポートのご予約

「チームによる共同作業」をサポート

SSAファイルをチームで共有することも可能ですから、解釈をみんなでやるのも、ディスカッションするのも簡単です。 さらに、第三者による再解析も簡単にできるので、データ解析そのものの信頼性が担保されます。

「他の研究データとの比較」をサポート

ご自身の実験データだけでなく、他の研究データでも同じような現象が起こっているかどうかを確認できれば、とても参考になります。 解析結果はSubriumに登録されますので、このような比較が簡単にできます。

また、インターネットに接続できる環境であれば、どこからでもSubio PlatformおよびSSAファイルをダウンロードできます。 出張先で急にデータが必要になった時でもデータを見ることができます。 解釈は、おそらく何年かかけてじっくりデータと向き合うことになりますので、何か閃いた時にすぐにデータを見られるようにしておくことが重要です。 チャンスを逃さないための仕組みを、まったくコストをかけずに実現できます。

価格とお申込み方法

Data Analysis Serviceは、下記のファイルを対象としています。

  • マイクロアレイ(遺伝子発現、miRNA、エクソン、CGH等)の生データ(テキスト、エクセル、CELファイルなど)
  • RNA-Seqから得られたcountsやFPKM、RPKMの数値テーブル(テキスト、エクセル)
  • ChIP-seqやMethyl-seqのBEDまたはテキストファイル
  • GEOのアクセッション番号(GSEやGDS)、またはデータのダウンロードURL
  • NGSのFASTQファイルをお持ちの方は、FASTQファイル処理サービスを合わせてご利用ください。

1データセットあたりのサービス料金の目安は下記のとおりですが、正式な金額はデータを拝見した後に提示させていただきます。 このサービスのご利用を検討されている方は、Data Analysis Service を注文する手順をご覧ください。

プラグインセットをご購入になった方は、Data Analysis Serviceをとても安価にご利用いただけるようになっております。 たくさんデータを出す研究者にとってお得なのはもちろんですが、 そうでない方にとっても実験前のアセスメントや結論の検証などの目的で他者の研究データをご利用になると役に立つことが多いです。 ぜひプラグインセットと合わせてご活用ください。

価格
通常価格 200 USDから
プラグインセット購入者優待価格 100 USDから
プラグインセット購入者優待価格
(Subriumへのデータ登録なし)
50 USDから
価格
通常価格 200 EURから
プラグインセット購入者優待価格 100 EURから
プラグインセット購入者優待価格
(Subriumへのデータ登録なし)
50 EURから
価格
通常価格 20,000 JPYから
プラグインセット購入者優待価格 10,000 JPYから
プラグインセット購入者優待価格
(Subriumへのデータ登録なし)
5,000 JPYから
Back to Top