データ解析サービスRNA-Seq解析・マイクロアレイ解析・他

丸投げするためのサービスではありません。

あなたが生物学的解釈に集中できるよう、

準備をしてお渡しするサービスです。

解析の準備 データインポート 正規化・前処理 視覚化・検証 統計解析 生物学的解釈 外注可 外注不可

図の作業工程をご覧ください。 これらの作業には、あまり重要でなく誰かに任せてもいいパート(灰色)と、決定的に重要で他人に任せられないパート(黄色)があるのですが、データ解析の経験のない人ほど全体像が分からず、手順通りに逐次進めようとします。 そして、あまり重要でないところに時間と集中力を使い果たし、いちばん大事なところを疎かにしてしまう傾向があります。 これでは本末転倒です。

また、Subio以外にデータ解析を依頼した場合、解析結果として渡されるのは、Fold値やP値付きの発現差のある遺伝子リスト(エクセル)と、ヒートマップなどの図(画像またはPDFファイル)です。 本来それらは、そこから始まるデータの理解・解釈・発見に向けた試行錯誤の叩き台に過ぎない代物です。 にもかかわらず、それを行えるような操作性も多面的表示性能も持たないため、あたかも最終結果と勘違いされるのです。 しかし、これではオミクスデータを十分に活かすことなど到底できません。

Subioのデータ解析サービスでは、外注可能部分の作業を引き受けて、データをSSA(Subio Series Archive)ファイルにして納品します。 これをSubio Platformにインポートすることで、生データから解析のプロセスをすべて見ることができ、また変更を加えることもできます。 ここから始まる、お客様自身が引き受けなければいけない大変な作業をできるだけスムーズに開始できるよう準備するのが、Subioのデータ解析サービスです。

納品後のアフターサービス

解析データの納品後には、ウェブ会議にて、データの特徴と、限界、そしてもしあれば問題点をSubio Platformを使って視覚的に説明します。 そして、そのデータの特徴に合わせてどのような解析手法を選択したかを、順を追って解説します。

その後もご不明な点は、ウェブ会議やメールでいつでも、何度でも無料でご相談いただけます。 一度にたくさんの情報を理解するのは無理がありますので、分からないことが出てきた時に、その都度ご相談いただくのが効果的です。 ですから、どうぞお気軽にお尋ねください。

Subioのデータ解析サービスはそこまでカバーして、この価格です。 利用しない理由が見つからないのでは?

オンラインサポートのご予約

プラグインがあれば、追加解析を自由自在に

納品するSSAファイルに解析結果は含まれていますが、プラグインがあれば追加解析を自由自在に行うことができます。

プラグインセットをご購入のお客様は、ご購入から一年間、データ解析サービス および オンライン・トレーニング をいつでも、何度でも半額でご利用いただけます。 ご自身の実験データだけなく、公共データベースのデータセットの解析にもご利用いただけますので、データ解析サービスをご検討でしたら、ぜひプラグインセットと合わせてのご購入をご検討ください。

データセット、および対象となるデータの種類について

このサービスは、サンプルごとではなく、データセット単位での課金となります。 Gene Expression Omnibusでいうと、Dataset (GDS) または Series(GSE)ごとの課金です。 1つのデータセットあたり100サンプルまではスモールデータセット、それ以上のサンプルが含まれる場合はラージデータセットとなります。 また、100サンプル以内のデータセットでも、データ行が10万行を超える場合はラージデータセットとしてカウントします。

このサービスの対象となるデータの種類についてですが、基本的にはIDとそれに対応するなんらかの数値のテーブルであれば、どのようなデータにも対応いたします。

対象となるオミクスデータの例:

  • 遺伝子発現データ
  • miRNA発現データ
  • エクソンやスプライシングバリアントの発現データ
  • ChIP-chipまたはChIP-seqデータ
  • CGHデータ
  • DNAメチル化データ
  • プロテオームデータ
  • メチロームデータ

価格

価格 プラグインセットユーザー様
特別価格 *6
スモールデータセット *1 *2 200 USD 100 USD
ラージデータセット 500 USD 250 USD
PDFレポートオプション *3 200 USD 100 USD
CD/DVD納品オプション *4 50 USD 25 USD
納期指定オプション *5 合計金額の50% 合計金額の50%
価格 プラグインセットユーザー様
特別価格 *6
スモールデータセット *1 *2 200 EUR 100 EUR
ラージデータセット 500 EUR 250 EUR
PDFレポートオプション *3 200 EUR 100 EUR
CD/DVD納品オプション *4 50 EUR 25 EUR
納期指定オプション *5 合計金額の50% 合計金額の50%
価格 プラグインセットユーザー様
特別価格 *6
スモールデータセット *1 *2 20,000 JPY 10,000 JPY
ラージデータセット 50,000 JPY 25,000 JPY
PDFレポートオプション *3 20,000 JPY 10,000 JPY
CD/DVD納品オプション *4 5,000 JPY 2,500 JPY
納期指定オプション *5 合計金額の50% 合計金額の50%
  • *1 スモールデータセットとは、10万行以下且つ100サンプル以下。 それを超えるものはラージデータセット。
  • *2 FASTQファイル処理から依頼される場合は、追加料金(.fastq.gzファイルのサイズの合計に対し5GBごとにスモールデータセット一つ)を頂きます。 Paired-endサンプルの場合は、片方のファイルだけを合算して、追加料金を計算します。 HISAT2のインデックス構築が必要な生物種の場合は、さらにスモールデータセット1つ分を加算させていただきます。
  • *3 ウェブ会議にてデータおよび解析手法の解説をしますが、その内容をファイルとして保存しておきたい方にはPDFレポートを作成します。
  • *4 物品による検収が必要で、ダウンロードによるデータ納品が受け付けられない場合には、こちらのオプションを追加してください。
  • *5 納期の目安は2週間以内ですが、保証はしておりません。 納期を指定される場合は、納期指定オプションをあわせてご購入ください。 指定日の16:00までに納品します。
  • *6 プラグインセットご購入日から一年間有効

スモールデータセット

  • 通常価格
    200 USD
  • プラグインセットユーザー様特別価格 *
    100 USD

スモールデータセットとは、10万行以下且つ100サンプル以下。 それを超えるものはラージデータセット。

FASTQファイル処理から依頼される場合は、追加料金(FASTQファイルのサイズの合計に対し5GBごとにスモールデータセット一つ)を頂きます。 Paired-endサンプルの場合は、片方のファイルだけを合算して、追加料金を計算します。

* プラグインセットご購入日から一年間有効

ラージデータセット

  • 通常価格
    500 USD
  • プラグインセットユーザー様特別価格 *
    250 USD

PDFレポートオプション

  • 通常価格
    200 USD
  • プラグインセットユーザー様特別価格 *
    100 USD

ウェブ会議にてデータおよび解析手法の解説をしますが、その内容をファイルとして保存しておきたい方にはPDFレポートを作成します。

CD/DVD納品オプション

  • 通常価格
    50 USD
  • プラグインセットユーザー様特別価格 *
    25 USD

物品による検収が必要で、ダウンロードによるデータ納品が受け付けられない場合には、こちらのオプションを追加してください。

納期指定オプション

  • 通常価格
    合計金額の50%

納期の目安は2週間以内ですが、保証はしておりません。 納期を指定される場合は、納期指定オプションをあわせてご購入ください。 指定日の16:00までに納品します。

スモールデータセット

  • 通常価格
    200 EUR
  • プラグインセットユーザー様特別価格 *
    100 EUR

スモールデータセットとは、10万行以下且つ100サンプル以下。 それを超えるものはラージデータセット。

FASTQファイル処理から依頼される場合は、追加料金(FASTQファイルのサイズの合計に対し5GBごとにスモールデータセット一つ)を頂きます。 Paired-endサンプルの場合は、片方のファイルだけを合算して、追加料金を計算します。

* プラグインセットご購入日から一年間有効

ラージデータセット

  • 通常価格
    500 EUR
  • プラグインセットユーザー様特別価格 *
    250 EUR

PDFレポートオプション

  • 通常価格
    200 EUR
  • プラグインセットユーザー様特別価格 *
    100 EUR

ウェブ会議にてデータおよび解析手法の解説をしますが、その内容をファイルとして保存しておきたい方にはPDFレポートを作成します。

CD/DVD納品オプション

  • 通常価格
    50 EUR
  • プラグインセットユーザー様特別価格 *
    25 EUR

物品による検収が必要で、ダウンロードによるデータ納品が受け付けられない場合には、こちらのオプションを追加してください。

納期指定オプション

  • 通常価格
    合計金額の50%

納期の目安は2週間以内ですが、保証はしておりません。 納期を指定される場合は、納期指定オプションをあわせてご購入ください。 指定日の16:00までに納品します。

スモールデータセット

  • 通常価格
    20,000 JPY
  • プラグインセットユーザー様特別価格 *
    10,000 JPY

スモールデータセットとは、10万行以下且つ100サンプル以下。 それを超えるものはラージデータセット。

FASTQファイル処理から依頼される場合は、追加料金(FASTQファイルのサイズの合計に対し5GBごとにスモールデータセット一つ)を頂きます。 Paired-endサンプルの場合は、片方のファイルだけを合算して、追加料金を計算します。

* プラグインセットご購入日から一年間有効

ラージデータセット

  • 通常価格
    50,000 JPY
  • プラグインセットユーザー様特別価格 *
    25,000 JPY

PDFレポートオプション

  • 通常価格
    20,000 JPY
  • プラグインセットユーザー様特別価格 *
    10,000 JPY

ウェブ会議にてデータおよび解析手法の解説をしますが、その内容をファイルとして保存しておきたい方にはPDFレポートを作成します。

CD/DVD納品オプション

  • 通常価格
    5,000 JPY
  • プラグインセットユーザー様特別価格 *
    2,500 JPY

物品による検収が必要で、ダウンロードによるデータ納品が受け付けられない場合には、こちらのオプションを追加してください。

納期指定オプション

  • 通常価格
    合計金額の50%

納期の目安は2週間以内ですが、保証はしておりません。 納期を指定される場合は、納期指定オプションをあわせてご購入ください。 指定日の16:00までに納品します。

ご注文フォーム

お申し込みを検討されている方は、下記のフォームにご注文内容を入力し、支払方法・出荷方法を選択して"Calculate"ボタンを押してください。

"Calculate"ボタンを押すと合計金額が表示されますので、内容をご確認いただき、よろしければ、お名前・ご連絡先等を記入して"Place Order"ボタンを押してください。 その後、担当よりメールでご連絡差し上げます。

JPY USD EUR

プラグインセット(1年ライセンス)

960 USD / 年 960 EUR / 年 96,000 JPY / 年
720 USD / 年 720 EUR / 年 72,000 JPY / 年

データセットとオプション

200 USD
200 EUR
20,000 JPY
500 USD
500 EUR
50,000 JPY
200 USD
200 EUR
20,000 JPY
50 USD
50 EUR
5,000 JPY
合計金額の50%
16:00

支払方法と出荷方法

代理店を選択した場合、代理店の手数料が別途加算されます。

サービスご利用の流れ

1遺伝子アノテーションファイルを用意する

RNA-Seqの場合は特に必要ありませんが、このアノテーションをつけてほしいというデータがありましたら、テキストファイルをご用意ください。

アフィメトリクスやアジレントから市販されているカタログアレイをお使いでしたら、そのアレイの名前を教えていただくだけで結構です。 IDを控えておいてください。

カスタムマイクロアレイの場合は、メーカーより提供されるテキストファイルをご用意ください。

2実験データファイルを用意する

下記のいずれかの形式で、実験データをご用意ください。

  • RNA-SeqのFASTQファイル、または counts/TPM/FPKM/RPKMなどのテキスト/Excelファイル
  • 遺伝子発現、miRNA、エクソン、CGHなどのマイクロアレイ実験の生データ(テキスト、エクセル、CELファイルなど)
  • ChIP-seqまたはMethyl-seqのBED またはテキストファイル
  • プロテオームまたはメタボロームのテキストファイル
  • GEOのアクセッションID(GSEまたはGDS番号)や、解析したいデータセットの生データをダウンロードできるウェブサイトのURL

もし、どのファイルを送ればよいかわからない時は、ウェブ会議で画面を見せていただきながら指示させていただきますので、オンラインサポートをお申し込みください。

3サンプル名と実験パラメータとの対応表などを用意する

サンプル名(ファイル名)と実験パラメータを関連付ける表を、テキストまたはエクセルファイルでご用意ください。

また、実験デザインおよび目的について資料があればご準備ください。 どのような発現パターンを示す遺伝子に興味があるのかなどがございましたら、それも資料の中でお知らせください。

4ファイルを送る

上記の手順1~3でご用意いただいたファイルを、1つにまとめてZIPで圧縮してください。 このZIPファイルをお問い合わせページからお送りください。

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5解析結果を受け取る

解析結果は、SSAまたはSOAファイルで納品されます。 これは、Subio Platformにインポートすることでファイルの中身をご覧いただけるようになります。 Subio PlatformのPlatformメニューから、"Import Archive..." を選んでインポートしてください。

6ウェブ会議で説明を受ける

データ解析サービスには、ウェブ会議による解説が含まれています。 生データの特徴と、その特徴に合わせた解析手順の説明をさせていただきます。 この説明を受けて、解析方法の変更や追加のご依頼があれば承ります。 その場合は、後日SSAまたはSOAファイルを再度納品いたします。 それより後の追加解析は、改めてデータ解析サービスをご利用ください。

出張データ解析サービス

お客様の研究室あるいはご指定の場所に出向いて、解析サービスを提供します。 料金は1日単位のサービス料金と出張料金の合計です。 スケジュールの調整がつけば何日でも可能です。

データサイズ(サンプル数や行数)に関係なく、一律料金です。 ただし、1日あたりの作業時間は最大6時間です。 解析について対面での綿密なディスカッションが必要な場合に最適です。 また、研究所の外に出せない秘密情報や個人情報を扱うデータの解析にも対応可能です。

出張解析サービス料金

価格 プラグインセットユーザー様
特別価格
出張解析サービス1日目 1,000 USD 700 USD
2日目以降 1日あたり 500 USD 350 USD
価格 プラグインセットユーザー様
特別価格
出張解析サービス1日目 1,000 EUR 700 EUR
2日目以降 1日あたり 500 EUR 350 EUR
価格 プラグインセットユーザー様
特別価格
出張解析サービス1日目 100,000 JPY 70,000 JPY
2日目以降 1日あたり 50,000 JPY 35,000 JPY

出張解析サービス1日目

  • 通常価格
    1,000 USD
  • プラグインセットユーザー様特別価格
    700 USD

2日目以降 1日あたり

  • 通常価格
    500 USD
  • プラグインセットユーザー様特別価格
    350 USD

出張解析サービス1日目

  • 通常価格
    1,000 EUR
  • プラグインセットユーザー様特別価格
    700 EUR

2日目以降 1日あたり

  • 通常価格
    500 EUR
  • プラグインセットユーザー様特別価格
    350 EUR

出張解析サービス1日目

  • 通常価格
    100,000 JPY
  • プラグインセットユーザー様特別価格
    70,000 JPY

2日目以降 1日あたり

  • 通常価格
    50,000 JPY
  • プラグインセットユーザー様特別価格
    35,000 JPY

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