解析ガイド

この解析ガイドでは、Subio Platformを使ったRNA-Seq、マイクロアレイ、DNAメチル化データ、ChIP-chip、ChIP-SeqやATAC-Seq由来のゲノム位置データ、プロテオミクス、メタボロミクスなど、さまざまなオミクスデータ解析の基本的な流れを、Subio Platformの操作と対応づけて学べます。

データのインポート、Series/DataSetの作成、正規化・前処理、フィルタリング、発現差解析（差のある遺伝子・プローブ・分子の抽出）、多変量解析（PCAやクラスタリング）、生物学的な解釈（GO解析やパスウェイ解析）、ゲノム上の位置や配列情報を使った解析、データ共有まで、解析の各ステップごとに関連する操作ガイドをまとめています。

一つのデータセットを使って全体の流れを体験したい場合は、RNA-Seqデータ解析チュートリアルをご覧ください。 必要な部分だけを確認したい場合は、下の解析ワークフローから該当するステップを選んでください。

目的に合わせた使い方

• 全体の流れを学びたい方： RNA-Seqデータ解析チュートリアルで、FASTQ処理、正規化、可視化、発現差解析、生物学的解釈までの流れを体験できます。
• 操作方法を部分的に確認したい方： 下の解析ワークフローから、詳しく知りたい項目を選んでください。 その項目に関連する記事のリストから、具体的な操作を学べます。
• 自分のデータで相談したい方： 時間のない方や年に数回しかデータ解析をしない方にはデータ解析サービスを、しっかり学んでご自身で判断できるようになりたい方にはオンライントレーニングをご用意しています。