フィルターで、測定値の信頼できない遺伝子を除く。
統計解析をする前に、解析にとってノイズとなる遺伝子を Filter ツールを使って除きましょう。具体的には、すべてのサンプルにおいてシグナルがノイズ領域から出ない遺伝子や、発現変動しない遺伝子を除きます。
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0:10 ここで例として使うデータセットの概要
0:25 DataSetまたはSample GroupをFilter画面にセットする
0:55 個別のサンプルにおいて発現が低すぎて信頼できない遺伝子を見つける
1:20 すべてのサンプルにおいて発現が低すぎて信頼できない遺伝子を見つける
1:50 個別のサンプルではなく、すべての「グループ」において発現が低すぎて信頼できない遺伝子を見つける
2:40 グループ間で発現変動のない遺伝子を除去する
3:10 視覚化ツールを使って試行錯誤しながら、閾値を決める
4:00 解析例１： 発現していない遺伝子を見つける
6:10 解析例２： 厳格に発現量が調節されている遺伝子を見つける