Create A Platform of An Affymetrix Gene Chip
0:00 Affymetrix のウェブサイトから、CSV 形式の annotation ファイルをダウンロードする
0:30 拡張子を .csv から .txt に変更する
0:45 エクセルで開いてタブ区切りテキスト形式のファイルに変換する、ただしこのやり方でないと、一部の Gene Symbol が日付に変わってしまうので注意
1:20 タブ区切りテキストをインポートして、Platform を作成する
1:50 gene symbol 列をセットする
2:00 UCSC Genome Browser サイトから、Probe set IDとゲノム位置の情報をダウンロードする
2:30 Chip名を除いて、probe set ID だけになるようにファイルを編集する
2:45 Edit Platform を開いて、不要な情報を削除する
3:20 Look Up ツールを使って、ゲノム位置の情報をインポートする
4:10 ゲノム位置情報のための特別なカラムに、コピー＆ペーストで移動する
4:25 いらない列を削除して、保存する
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