この90秒動画では、Subio PlatformのBasic Plug-inに含まれるPCAツールを使って外れ値候補のサンプルを見つけ、 Line Graphやヒストグラムなどの他のビューで確認する流れを紹介します。
目的は、PCA上で離れて見えるサンプルを機械的に除外することではありません。 なぜ他のサンプルと違って見えるのかを、複数の視点から確認し、 解析をどのように進めるかを判断することです。
RNA-Seq解析の標準的なワークフローでは、PCAやクラスタリングなどによるデータの状態確認を探索的データ解析（EDA）と呼ぶことがあります。しかし、探索的データ解析の本来の目的は、データの状態確認にとどまらず、生物学的な仮説を生み出し、研究上の問いや解析方法を発展させていくことにあります。
PCAについて詳しく
→ RNA-Seq データ解析チュートリアル：PCAとクラスタリング
ショート解説シリーズの次の動画
→ ショート解説2：フィルタリングで解析対象を整える