シロイロナズナの Genome を作成する (TAIR10、TAIR9)

TAIR のウェブサイトからは、Arabidopsis の遺伝子の位置情報が GFF3 フォーマットで提供されています。TAIR10_GFF3_genes.gff をダウンロードしてください。

Subio Platform では、これらのファイルを使って Genome を作成することができますが、GFF データからの変換には時間がかかります。

そこで、このデータからexons、miRNAs、ncRNAsに関するものを抜粋して BED フォーマットにしたものが下のリンクからダウンロードでき、こちらを使ったほうが Genome の作成がずっと早くできます。

TAIR10 BED

https://www.dropbox.com/s/voj2r4wn24gptci/TAIR10.zip?dl=1

TAIR9 BED

https://www.dropbox.com/s/7pm1ofsxlfxfb84/TAIR9.zip?dl=1