実験計画支援サービス

測定手法の性能は目的に見合ってますか?

N数をどのように決めてますか?

実験失敗のリスク対策してますか?

良い研究は、優れた実験計画から。たった1万円で絶大な効果。

「ある薬剤で処理した実験区と対照区の比較を、RNA-SeqでN5でやりたいので見積りを下さい。」のように、実験手法とN数を指定して尋ねてくるのは、実はオミクス実験の経験の浅い人ほど多いです。 普通の受託サービスなら、そのまま見積りをすることでしょう。

しかし、Subioは違います。 お客様の実験計画にきちんと向き合うので、ご相談の結果、当初の考えとは異なる手法やN数を採用されることはよくあります。 それにより、当初の予算より安く済むこともあります。 実験は、Subioのプレミアム実験受託サービスをご利用になっても、ご自身あるいは他の実験受託サービスで行われてもかまいません。

なぜ1万円払ってでも実験計画の相談をする価値があるのか。 そして、なぜそれが百万円単位の節約あるいは損失回避につながるのか。 理由をご覧ください。

まず、実験区とN数の割り当てこそ、工夫のしどころです。

予算・時間・人員が無尽蔵に使えるのであれば、理論上最適な実験計画を策定すれば済むことなのですが、現実世界には様々な制約があります。 マイクロアレイやRNA-Seqでいちばんネックとなるのは予算でしょう。 統計学が想定するサンプル数に対してオミクス実験のサンプル数は少な過ぎるので、統計学的要求に闇雲に従うのは無意味です。 私たちの解析経験から言うと、生物学的な背景・メカニズムを推定しながらうまく実験区を割り当てることのほうが決定的に重要です。 とは言え、論文にするときに予想されるレフリーからの要求も勘案しなくてはなりません。 バランスの良い落としどころにするのに、Subioの豊富な解析経験が役に立ちます。

具体的なことはケースバイケースですので、ぜひご相談ください。

次に、どの手法を採用するかは、アセスメントして決めましょう。

オミクス実験の経験の浅い人ほど、測定システムに過剰な信頼を寄せがちです。 「学会で聞いた」「研究者仲間から聞いた」「メーカーから聞いた」情報はすべてバイアスがかかっていますので、鵜呑みにしてはいけません。 採用しようと思っている手法の実力が期待通りなのか、それとも力不足なのか、それを確かめてから判断する慎重さが多大な時間とお金を救います。

メーカーが提供するサンプルデータは、実際の研究データよりもかなり質が良いと割り引いて考えなくてはいけません。 もっと参考になるのは、公共データベースにある他の研究者の実験データです。 同じ生物種・組織・細胞・病気などの研究データでなくてもかまいません。 その手法の実力・限界・問題点を具体的に知ることが目的です。

Subioのデータ解析サービスは、アセスメントの目的でもご利用いただけます。 実際の研究データを解析してみることで、どのようなデータ解析をして、どのようなアウトプットが得られるかを具体的にイメージすることができ、これは実験計画を策定するうえで重要なヒントになります。 アセスメントに多少の時間とお金がかかったとしても、十分に元のとれる出費です。

最後に、不測の事態に備えてリスク対策を実験計画に組み込みましょう。

実験計画を作っている時に見落としがちなのは、実験は必ず成功するとは限らないという事実です。 実験に失敗は付き物です。 リスクを回避したい気持ちはわかりますが、すべて取り除くことはできません。 ここで大事なのは、(1)起こりやすい失敗は何か、(2)ダメージの大きい失敗は何か、という二つの観点から対処すべきリスクを選び出して、その対策を実験計画に組み込むことです。

このうち、(2)は誰でも考えやすい事柄です。 それに対して、(1)はデータ解析経験が豊富でないとわかりません。 さらに、実験を自分でする場合と、受託サービスに外注する場合では、起こりがちな失敗が異なります。 Subioがお役に立てるのは、まさに(1)の視点を提供できること、そして、その具体的な対応策を提案できることです。

リスク対策はタダではありません。 そのためにサンプル数を割く必要がありますから、コスト対効果を考えて判断しなければなりません。一方で、コストのかからない対策もあります。 たとえば、サンプルにどのようなラベリングをするかや、外注先へどのように発注するかはコストのかからない対策ですが、これだけでもリスクを大きく削減できます。 大小さまざまな対策を組み込みながら、実験計画を堅牢で、たとえ何か起こったとしても影響を最小限に抑えるように仕立て上げるのです。 このために、Subioのノウハウを惜しみなく提供します。

価格

価格
実験計画支援サービス 100 USD
アセスメントは別料金です。データ解析 Serviceサービスをご利用ください。
価格
実験計画支援サービス 100 EUR
アセスメントは別料金です。データ解析 Serviceサービスをご利用ください。
価格
実験計画支援サービス 10,000 JPY
アセスメントは別料金です。データ解析 Serviceサービスをご利用ください。
  • 実験計画支援サービス
    100 USD

アセスメントは別料金です。データ解析 Serviceサービスをご利用ください。

  • 実験計画支援サービス
    100 EUR

アセスメントは別料金です。データ解析 Serviceサービスをご利用ください。

  • 実験計画支援サービス
    10,000 JPY

アセスメントは別料金です。データ解析 Serviceサービスをご利用ください。

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