miRNAとターゲット遺伝子で、発現パターンが逆向きのペアを検索する。
Find miRNA Targets ツールは、遺伝子とmiRNAの実験データが対でそろっている場合に使えます。ここでは、実験的に検証されたmiRNAとターゲット遺伝子のペアや、計算によって予測されたmiRNAとターゲット遺伝子のペアのうち、発現パターンが逆相関になっているものを抽出します。すべてのペアについて相関係数の分布が出ますので、全体の傾向もつかむことができます。
遺伝子発現データ(GSE34679)とmiRNAの発現データ（GSE34680)のSSAファイルをダウンロードできるので、あなたのコンピューターで試してみてください。
このツールの使い方がよくわからないときは、無料オンラインサポートをお申し込みください。
関連トピック
- Find Matched Samples ツールを使うと、エクセルでの面倒な作業が必要なくなるので、準備が簡単になります。