Subio Platformの新しいバージョンをリリースしました。Kaplan-Meier生存曲線でP値が出るようになったほか、RNA-SeqのためにNormalizationシナリオを調整、WindowsでGDCのmiRNA-Seqのデータをダウンロードできない問題の解決などが含まれています。
IMPROVEMENTS in Advanced Plug-in
- Kaplan-Meier Survival Curve tool で、一般化ウィルコクソン検定またはログランク検定の計算ができるようになりました。
CHANGES in Subio Platform
- ノーマライズシナリオを見直し、整理しました。特に、RNA-Seqのデータ解析のために"RNA-Seq (optimized for GDC counts)"を調整しなおしています。このシナリオはRNA-Seqデータ一般に使えますが、閾値等の調整は必要です。詳しくは、「マイクロアレイより少し複雑な、RNA-Seqのデータ解析手順」をご覧ください。
- Sample ListのAdvanced Filterで、Seriesの並び順をアルファベット順に変更しました。
FIXED PROBLEMs in Subio Platform
- WindowsのPCで、GDC miRNA-Seqのデータをダウンロードできない。
- Platformをマージすると、Sample Informationが表示されなくなることがある。
- Sample Info.タブでNotesに入力した直後に、Seriesをキーワード検索しても見つからない。
FIXED PROBLEMs in Basic Plug-in
- "Compare One to All" または "Compare All Pairs" ツールでP値の計算をすると、Subio Platformが落ちることがある。
FIXED PROBLEMs in System Plug-in
- コピーして作ったSeriesのSSAファイルに問題があり、インポートに失敗する。
- "Scan Genes over Series"ツールのインデックス作成に失敗することがある。
Update your Subio Platform.
Subio PlatformのHelpメニューから、"Check for Updates..."を選択してバージョンアップしてください。これでうまくいかないときは、下記のアップデータをダウンロードして手動で更新してください。