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パスウェイ解析・ネットワーク解析・GO解析はできますか?

GO解析について

Gene Ontology (GO) 解析でしたら、(1) DAVID Functional Annotation のウェブツールを使うか、(2) Advanced Plug-in に含まれる "Enrichment Analysis" ツールを使ってできます。さらに、後者は System Plug-in に含まれる "Import MSigDB Gene Sets" ツールを使うことで機能を強化できます。詳しくは、エンリッチメント解析のチュートリアルをご覧ください。

パスウェイ解析・ネットワーク解析について

パスウェイ解析やネットワーク解析という言葉は広い意味でつかわれているので、一概には答えられません。もし、特定のパターンを示す遺伝子リストを抽出した後に、その遺伝子群と関係のある(エンリッチしている)パスウェイを検索することができるかと聞いているのでしたら、それはエンリッチメント解析の一部です。エンリッチメント解析のチュートリアルをご覧ください。

しかし、もしオミクスデータからネットワークを推定して構築することができるか?と聞いているのでしたら、私たちにはできません。そのような手法はまだ開発途上の段階で、実用レベルには達していないと考えています。もし、特定のアルゴリズムを実装して機能提供すべきだとお考えでしたら、どうぞ機能リクエストをお送りください。または、ソフトウェア開発サービスをご利用になって、その機能を実装することもできます。