２群間で、統計学的有意に発現差のある遺伝子を抽出する。
Compare to Control ツールと Compare 2 Groups ツールは、Basic Plug-inの中でも Filter ツールの次に使用頻度が高いツールでしょう。Fold差や統計検定によって発現差がある遺伝子（DEG）を抽出し、Volcano Plot を描画します。検定は、one-sample t-test、Student's t-test、Welch's t-test、Mann-Whitney u-test が実行可能です。また、p-value は BH法による多重補正を行った q-value に変換できます。
このツールの使い方がよくわからないときは、無料オンラインサポートをお申し込みください。
0:00 データセットの概要説明
0:30 Compare to Control ツールの使い方
3:05 Compare 2 Groups ツールの使い方
5:50 ひとつのサンプルしか含まれないsample groupをセットしたとき
網羅的遺伝子発現データ解析の理論と実践