簡単かつ詳細なマイクロアレイデータ解析の例
多くの人が統計学などの特別なツールがないとデータ解析はできないと思っているようですが、オミクスデータ解析の本質にとってツールはそれほど重要ではありません。逆に言うと、そのツールさえ使っていれば解析については安心だということもないのです。大事なのは、データがどのようなものか、そしてどのように処理しているかを正しく理解していることです。
このチュートリアルを通して、初心者の方でもマイクロアレイデータ解析のエッセンスをひとおとり学ぶことができます。無料のSubio Platformを使って、どのようにデータの質を検証し、ノイズを除去し、発現差のある遺伝子を抽出し、染色体上の位置と発現変動の関係を調べることができます。そして、同じく無料の DAVID Functional Annotation を使って、エンリッチされたGOやパスウェイを検索するところまでお見せします。
SSAファイルをダウンロードすると、すぐにデータを開いてみることができます。Platformメニューの下から"Import Archive..."を選択して、SSAファイルを取り込んでください。