Subio Platform working with ChatGPT and Jupyter.
Subio Platformは、タブ区切りテキスト形式のファイルをインポート/エクスポートできます。これにより、Subio Platformやプラグインにない機能を補完するために、他のツールと連携して作業できます。Rスクリプトをコーディングできるなら問題ありません。Subio Platformのインターフェースとデータ管理機能と、Bioconductorの統計解析機能を組み合わせて使えます。
もしコーディングができなくても、最近の生成AIの発達により、ChatGPT にコードを生成させ、Jupyterでそれを実行させることが可能になりました。この動画ではその方法を示しています。 ChatGPTにコードを書かせるコツは、仕様とアルゴリズムを不足なく、明確に説明することです。ChatGPTがデータファイルのアップロードを求める場合がありますが、そのようなときは、代わりにPythonコードを生成するようリクエストしてください。
Jupyterはシンプルなユーザーインターフェースを備え、開発環境を構築せずにPythonコードを実行できます。生成されたテキストファイルをダウンロードし、Subio Platformにインポートして解析に利用することができます。