この動画では、ChatGPTを使ってRスクリプトを生成し、edgeRとDESeq2によるP値計算を行う方法を解説します。この方法は、他のRライブラリーやBioconductorツールにも応用できます。
複雑なコードを自分で書く代わりに、解析内容をテキストで定義し、ChatGPTにスクリプトを生成させてRで実行します。エラーが発生した場合も、ChatGPTを使って原因の特定や修正が可能です。
本動画では、以下の流れを実演します：
・Subio PlatformからGene Countsデータを出力
・解析用のデータシートを整形
・ChatGPTでRスクリプトを生成
・edgeRとDESeq2によるP値計算
・エラーの修正
・結果をSubio Platformにインポート
・P値の可視化と比較
このアプローチにより、コーディングではなく「データの解釈」に集中できるようになります。
この解析は、RNA-Seqデータ解析チュートリアルの一部です。
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