RNA-Seqデータ解析支援サービス

「フリー」ツールを学ぶか、

それとも、商用ソフトを買うか。

実は、どちらもコストが高い!

データ解析講習会などに参加した経験をお持ちの方も多いでしょう。 その場で教則本に従ってデモデータをなんとか処理し、解析らしいことまで一通りできたからと言って、あなたが自在に解析できるようになったわけではありません。 いざ自分のデータを解析してみようとしても、講習会では起こらなかったさまざまなエラーにより立ち往生した経験はありませんか?

そこで私たちは、お客様がニーズに合わせてお選びいただけるよう2種類のサービスを提供しています。
商用ソフトを購入するより、または技術講習会に参加するより、
安く早く確実な方法です。

RNA-Seqデータ処理受託

たくさんのFASTQファイルを処理する必要が無いのであれば、この作業のためにコンピューターやソフトウェアを買ったり、使い方を学ぶのに時間を使ったりするのは無駄です。

そのような方は、お手持ちのFASTQファイルをお送りください。 私たちのほうで count・FPKM・TPM などの遺伝子発現量のデータに変換して納品します。 RNA-Seqによる遺伝子発現データの解析は、マイクロアレイよりもトリッキーです。 変換された遺伝子発現データの解析は、引き続きデータ解析サービスにお任せください。

価格
RNA-Seqデータ処理 *1 *2 75 USD / Sample
サーバー利用料 *3 *4 200 USD
  • *1 シングルリードもペアードリードも1サンプルあたりの料金は同じです。
  • *2 QCとフィルタリングには fastp、マッピングには HISAT2 を使います。 数値化ツールは、Cufflinks、HTSeq、StringTie からお選びいただけます。
  • *3 多くの場合でReference Genomeはインターネットからダウンロードすることができますが、もしダウンロードできるものが無くて作成する必要がある場合は、サーバー利用料を加算します。
  • *4 対象のFASTQファイルを圧縮したgzファイルのサイズの合計が20GBを超える場合は、サーバー利用料を加算させていただきます。
価格
RNA-Seqデータ処理 *1 *2 75 EUR / Sample
サーバー利用料 *3 *4 200 EUR
  • *1 シングルリードもペアードリードも1サンプルあたりの料金は同じです。
  • *2 QCとフィルタリングには fastp、マッピングには HISAT2 を使います。 数値化ツールは、Cufflinks、HTSeq、StringTie からお選びいただけます。
  • *3 多くの場合でReference Genomeはインターネットからダウンロードすることができますが、もしダウンロードできるものが無くて作成する必要がある場合は、サーバー利用料を加算します。
  • *4 対象のFASTQファイルを圧縮したgzファイルのサイズの合計が20GBを超える場合は、サーバー利用料を加算させていただきます。
価格
RNA-Seqデータ処理 *1 *2 7,500 JPY / Sample
サーバー利用料 *3 *4 20,000 JPY
  • *1 シングルリードもペアードリードも1サンプルあたりの料金は同じです。
  • *2 QCとフィルタリングには fastp、マッピングには HISAT2 を使います。 数値化ツールは、Cufflinks、HTSeq、StringTie からお選びいただけます。
  • *3 多くの場合でReference Genomeはインターネットからダウンロードすることができますが、もしダウンロードできるものが無くて作成する必要がある場合は、サーバー利用料を加算します。
  • *4 対象のFASTQファイルを圧縮したgzファイルのサイズの合計が20GBを超える場合は、サーバー利用料を加算させていただきます。

RNA-Seqデータ解析環境構築支援

大量のFASTQファイルの処理が必要な場合、処理を実行できるコンピューターをお持ちでしたらそこで処理するほうがコストを削減できます。

私たちはウェブ会議やメールなどを通して、フリーのプログラムによる解析環境の構築や設定をお手伝いします。 これなら、そのパイプラインで処理を実行するための最小限の操作を学ぶだけで済みますし、実行時によくわからないエラーが出て解析できない事態になることも避けられます。 いったんパイプラインが動きはじめたら、その後同様のデータが出てきてもスムーズに処理することができるでしょう。

商用のソフトウェを購入するより、または講習会等に参加するよりも安く、早く、確実なソリューションです。 変換された遺伝子発現データの解析は、データ解析サービスにてお手伝いいたします。

価格
環境構築支援 *5 *6 300 USD
アフターサービス *7 100 USD / 時間
  • *5 処理に必要なコンピューター(実機またはクラウドサーバー)は、お客様のほうでご用意ください。
  • *6 1種類のデータにつき、「処理用コンピューターの選定 → ツールのインストール → 使い方の説明 → 実行 → エラーが起こった場合の対処 → count・FPKM・TPM などのファイルを出力」までを、環境構築支援サービス1回分とします。
  • *7 環境構築支援サービスをご利用になった方で、コンピューターの変更やデータフォーマットの変更などにより、構築した環境が動かなくなった場合に修正するお手伝いをします。
価格
環境構築支援 *5 *6 300 EUR
アフターサービス *7 100 EUR / 時間
  • *5 処理に必要なコンピューター(実機またはクラウドサーバー)は、お客様のほうでご用意ください。
  • *6 1種類のデータにつき、「処理用コンピューターの選定 → ツールのインストール → 使い方の説明 → 実行 → エラーが起こった場合の対処 → count・FPKM・TPM などのファイルを出力」までを、環境構築支援サービス1回分とします。
  • *7 環境構築支援サービスをご利用になった方で、コンピューターの変更やデータフォーマットの変更などにより、構築した環境が動かなくなった場合に修正するお手伝いをします。
価格
環境構築支援 *5 *6 30,000 JPY
アフターサービス *7 10,000 JPY / 時間
  • *5 処理に必要なコンピューター(実機またはクラウドサーバー)は、お客様のほうでご用意ください。
  • *6 1種類のデータにつき、「処理用コンピューターの選定 → ツールのインストール → 使い方の説明 → 実行 → エラーが起こった場合の対処 → count・FPKM・TPM などのファイルを出力」までを、環境構築支援サービス1回分とします。
  • *7 環境構築支援サービスをご利用になった方で、コンピューターの変更やデータフォーマットの変更などにより、構築した環境が動かなくなった場合に修正するお手伝いをします。
Back to Top